Нет, речь идет именно о 2-х этажном складском помещении (антресоль внутри склада) или 2-х этажном складском здании.
Если же, к примеру, есть школа, а в школе на 2-м этаже есть одноэтажный, без надстроек и антресолей склад завхоза 800 квадратов с категорией В2 или В3, то этот склад не подлежит защите АУП. Достаточно АПС.